菌肥是微生物肥料的俗稱，它是一種帶活菌體的輔助性肥料。

土壤中存在著大量的微生物（包括細(xì)菌、真菌、放線菌），一般每克土含有幾億至幾十億個(gè)微生物。有些對(duì)作物生長(zhǎng)發(fā)育有益，有些則有害。人們用科學(xué)的方法從土壤中分離、選育有益微生物，經(jīng)過(guò)培養(yǎng)、繁殖、制成菌劑，將這些菌劑應(yīng)用于農(nóng)業(yè)，使作物增產(chǎn)，稱為菌肥，又叫做微生物肥料。目前我國(guó)生產(chǎn)和應(yīng)用的菌肥主要有根瘤菌、固氮菌、磷細(xì)菌、鉀細(xì)菌、EM菌肥料等，均可解除要害，促進(jìn)生長(zhǎng)。

菌肥是通過(guò)有益微生物的生命活動(dòng)，拮抗有害微生物，促進(jìn)土壤中養(yǎng)分的轉(zhuǎn)化，提高土壤養(yǎng)分的有效性，改善作物營(yíng)養(yǎng)條件，增加土壤肥力。菌肥，可以葉面噴施、沾根等。